Có một số cách khác nhau nhưng tốt nhất là bạn làm như sau:
Khởi động từ đĩa CD mà trước kia bạn dùng để cài đặt Windows, thực hiện các bước như bạn muốn cài Windows bình thường, đến lúc chương trình hỏi bạn nhấn R để thực hiện việc Repair (lưu ý là không phải lúc chương trình hỏi bạn nhấn R để boot vào Recovery console) thì bạn nhấn R để việc repair được thực hiện. Windows sẽ được cài lại với các file và cấu hình giữ nguyên như cũ.
Tốt nhất là bạn nhờ một người có kinh nghiệm làm hộ, không nên tự "mày mò" nếu trên máy quả thực có nhiều dữ liệu quan trọng.