Câu trả lời là không ảnh hưởng gì tới cái đĩa boot đó miễn là còn đủ chổ trống cho những gì bạn muốn thêm vào và cần nhất là phải làm cho đúng cách.
Đề nghị bạn nên dùng Ultra ISO để tạo ra cái đĩa boot đó.
Đề nghị là thay vì thêm cái file gì đó thì bạn dùng unattend cho luôn cái phần đó vào trong phần cài đặt và làm lại cái đĩa boot tự động cài đặt luôn cho để dùng.